Outra modificação do substitutivo foi a inclusão de mais dois membros no Conselho Gestor do Fust. Agora, os ministérios da educação e saúde passam a ter um representante no conselho. Também foi acatada a sugestão dos deputados Marcelo Barbieri (PMDB/SP) e Silas Câmara (PFL/AM) que prioriza o destino de recursos do Fust para os estabelecimentos públicos de ensino. A última mudança no projeto determina que as empresas tornem público aos clientes que as contribuições ao fundo (que devem vir discriminadas nas contas) não ocasionarão aumento de preços e tarifas.
