O Fust será gerido por um conselho gestor composto por dois representantes do Ministério das Comunicações, dois da Anatel e um representante das empresas prestadoras dos serviços de telecomunicações. Estes conselheiros serão nomeados pelo Poder Executivo. A presidência deste conselho será de um dos conselheiros do Ministério das Comunicações, que também ficará encarregado de prestar apoio administrativo, técnico e financeiro ao fundo. Segundo o próprio relator do Fust, Salvador Zimbaldi, esta decisão foi tomada para atender interesses políticos. O conselho gestor deverá prestar contas, publicando no prazo de até 60 dias um demonstrativo das receitas e aplicações do fundo, informando, entre outras coisas, que entidades foram beneficiadas e como se deu a aplicação do dinheiro.
